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Ihhnv.隔离物之间的地理变异提供了对病理学的见解,蔓延

凯西唐 唐纳德·莱特纳,博士。

病毒引起了一些虾中的严重死亡,对他人的效果减少了

Ihhnv.
研究结果揭示了基于DNA序列同一性的四组IHHNV菌株。

病毒的基因组序列通过随机突变或选择压力来改变时间。这导致形成病毒菌株,这些病毒菌株可以随着宿主生物的影响而变化。在人或动物病毒中发现了许多实例。例如,流感病毒的菌株因毒力而异,并且对一个菌株有效的疫苗可能不会抵抗另一个菌株。

虽然虾病毒可以预期类似的变异,但很少的信息可用于虾病毒的遗传变异或其意义。

Ihhnv.

美国亚利桑那州图森大学亚利桑那大学养殖病理学实验室从世界各地接受患病虾的样本,并维持来自病毒感染的虾的组织样本。这有机会研究在宽地理区域收集的分离物之间的遗传变异。

特别感兴趣的是感染性皮下和造血坏死病毒(IHHNV)。这种病毒很普遍,并已在世界各地检测到,包括美洲,大洋洲,非洲和亚洲。其效果在敏感的宿主物种中显着变化,并且至少一个物种中的感染似乎发生了变化。

Ihhnv.在一些虾类中引起严重的死亡,但在其他物种中效果减少了。 1981年,当第一次发现病毒时(Penaeus tyletirostris),它与夏威夷的受感染人口最多90%的死亡人士有关。在最近的IHHNV感染病例中 P. Tyltirostris.,病毒似乎不那么毒性,表明病毒的变化或主体防御的变化。

其他物种的Penaeid虾对IHHNV感染不同。例如,未知IHHNV造成显着的死亡 P.Vannamei. or P. Monodon.,但它可以导致称为runt畸形综合征的疾病,这大大降低了增长,并且可能导致有粘膜和讲台畸形。

变异分析

作者最近研究了Ihhnv感染的样品 P.Byitirostris., P. vannamei. and P. Monodon. 来自包括夏威夷的各种地理区域;墨西哥;哥伦比亚;厄瓜多尔;巴拿马;菲律宾人;泰国;台湾;马达加斯加;和坦桑尼亚。

在分析分离物中的变化分析中进行了三种方法。首先将来自不同位置收集的样品的IHHNV基因组序列,第二个与感染的虾中的组织病理学变化进行了比较,第三次确定病毒分离物对检测在实验室生物测定中的虾的影响。

Ihhnv.
促进菲律宾IHHNV介绍和传播的途径。到1990年,Ihhnv在近乎所有虾类农业国家的美洲建立。

序列变异

对于每个样品,测定病毒基因组的所选区域的核酸序列。然后通过使用用于系统发育分析的统计聚类方法进行比较这些。

结果揭示了基于DNA序列标识的四组。菲律宾孤立含有99.8%的核苷酸序列同一性,夏威夷和中南部的分离株。泰国分离物与夏威夷孤立略微较低,泰国分离物略低,但与台湾隔离物质几乎相同。来自坦桑尼亚和马达加斯加的孤立株来自其他样品的最多(8-14%)。

组织病理学

通过常规的组织学方法分析牛仔感染这些分离株的虾在主靶组织中存在癌症型静脉内夹杂物体(CAI)。 Hallmark Cais在感染的夏威夷,菲律宾和泰国感染的虾中发现,表明DNA序列的小4%差异没有改变病毒的特征组织病理学。

这些感染的虾也显示为IhhNV感染阳性 原位 杂交。然而,在暴露于两种非洲分离物的虾中没有发现菌落,并且这些样品对IHHNV具有阴性 原位 hybridization.

生物测定

对于菲律宾和泰国IHHNV分离物,使用特异性无病原体在生物测定中进行实验室感染 P.Vannamei. 作为指标虾。在这些试验中,在接触IHHNV后,指标虾中没有死亡率。挑战的虾与PCR和PCR的IHHNV测试阳性 原位 hybridization.

在与马达加斯加Ihhnv的挑战研究中,虾在一个月后没有死亡率。另外,PCR和 原位 杂交对IHHNV负阴性,表明马达加斯加Ihhnv没有传染性 P.Vannamei。

结果

此信息允许将此病毒的拼图拼接在一起。序列分析数据支持菲律宾是IHHNV的原始来源的理论。它是通过的 P. Monodo.在20世纪70年代,N股进入美洲,后来“发现” P.Byitirostris. 在夏威夷培养。同样,台湾和泰国的隔离物之间的高相似性可能是由于泰国活汤汤虾的频繁转移和导入台湾。

两家非洲Ihhnv孤立的性质尚不清楚。它们是关于DNA序列的最分歧的分离物。用PCR检测非洲分离物,但不与组织学或 原位 hybridization.

在生物测定中,没有在任何一种madagascar孤立的感染 P. Monodon. 或者 P.Vannamei.。这些结果有许多可能性。非洲Ihhnv感染水平可能 P. Monodon. 非常低,因此无法通过组织学和 原位 杂交。或者,病毒可以以不再感染的形式存在。负责复制的基因组区域的序列变异高于其他IHHNV分离物和大多数剖腹症。

这可能表明分离物不再能够复制,并且IhHNV基因组的残余与...相关 P. Monodon. 主持人。如果是这样,这可以解释为什么Ihhnv在西印度洋 P. Monodon. 似乎不传染性。

结论 

核酸序列数据可用于识别感染Penaeid虾的病毒的地理起源。对序列变异的研究表明,IHHNV菌株的差异显着差异及其病理效应。此外,该工作表明,病毒的至少两个菌株如何变得如此普遍。

三十年前西半球Ihhnv的出现可能来自Ihhnv感染的介绍 P. Monodon. 来自菲律宾。因为Ihhnv感染是无症状的 P. Monodon. 除了严重的病例外,病毒的存在可能已经逃脱了通知,直到其他易感物种的股票被感染。

(编辑’S注意:本文最初发布于2004年2月印刷版 全球水产养殖倡导者。)


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