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贝类中的人类肠道病毒,第3部分

小乔治·弗里克(George J. Flick),博士 David D.Kuhn博士

多数胃肠炎病例可追溯到诺如病毒

肠病毒
在研究中,在相同的受灾地区以不同的养殖方法养殖的贝类同样参与了病毒污染。

如本系列以前的文章所报道,诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要原因,并已在医院,游轮,军事和度假营地,疗养院,托儿所,旅馆和饭店中报告。流行病学研究估计,诺如病毒占全球所有食源性胃肠炎暴发的60%至80%。食用贝类是诺如病毒感染的三种主要传播途径之一。

本文讨论了病毒在海水和贝类中的存在及其重要性。重要的是要注意,研究报告中的某些软体动物贝类是从禁止区域,被称为未处理污水的区域或欧盟委员会分类为B和C的生长区域中获得的。因此,由于直接人类食用的采收限制,某些研究可能未反映出人类患病的可能性。

同样重要的是要认识到,贝类病毒暴发可能是由多种病毒引起的。在法国贝类生产泻湖附近发生2006年水灾之后,爆发了205例肠胃炎与牡蛎食用有关。分析显示,从不同个体收集的12份粪便样本中,有8份对多种肠病毒呈阳性,而一份粪便样本中含有7份肠病毒。贝类受到多达五种不同的肠病毒的污染。在欧洲,牡蛎样品中首次检测到爱知病毒。

荷兰

在一项研究中,检查了来自荷兰牡蛎养殖场的贝类和从其他国家(德国,爱尔兰,丹麦,法国和英国)进口的贝类是否存在诺如病毒污染。荷兰养殖场的21个牡蛎样本中有1个(4.8%)是诺如病毒阳性,而在荷兰进口后直接采集的8个牡蛎样本中的一个(12.5%)和13个贻贝样本中的5个(38.5%)中检测到了诺如病毒。

牡蛎中的诺如病毒污染被鉴定为基因型I.4,贻贝中的被鉴定为GI.4和GIIb。贻贝受到更大污染的原因与从牡蛎中比牡蛎更有效地回收病毒有关。

西班牙

从2011年1月至2012年6月,在西班牙西北部两个地区的10个贝类捕捞地区进行了为期18个月的调查。每个样本均由10个贻贝或20个蛤and和海蛤组成。样本包括野生和筏式养殖的地中海贻贝, 鹦鹉螺;马尼拉和蛤壳蛤, 菲律宾Venerupis金星座;和鸟蛤 皮肤皮疹。

总体而言,有55.4%的样品被至少一种所研究的病毒污染-诺如病毒和甲型肝炎-而11.3%的样品被两种或三种病毒污染。诺如病毒GI占32.1%,是最流行的病毒,其次是诺如病毒GII(占25.6%)和肝炎(10.1%)。研究结果列于表1。

养殖贻贝的阳性样品数量最多,其次是蛤和野生贻贝。大多数阳性样品的病毒污染水平为102 to 103 RNA拷贝/克消化组织。据统计,在4月至9月的温暖月份,病毒污染的发生率高于10月至3月的寒冷月份。

意大利

样品 鸡没食子菌 青口贝, 菲律宾磁带 蛤和 景天属 gigas 从意大利波河三角洲的两个收获区收集牡蛎。一年中每月共收集70个样本(每个区域35个),用于测定诺如病毒GI和GII。在51.4%的样本中发现诺如病毒污染,其中2.9%的样本仅包含NoV GI,14.3%的样本仅包含GII,而34.3%的样本包含两种基因型。在2008年11月至2009年4月期间获得了约90.0%的阳性结果。两个收获地区的阳性样品频率之间没有统计学差异。

肠病毒
牡蛎和其他类型的贝类可能受到几种病毒株的污染。

 

贻贝的阳性结果出现率最高,为60.9%,在15个采样中的14个中检测为阳性。尽管养殖程序不同,但贝类也同样参与了病毒的污染–泻湖上的蛤,附在种群上的绳子上的贻贝和浮笼中的牡蛎。

在进一步研究中,从2007年7月至2010年4月,在胃肠炎暴发后,从收获地区,授权和非授权零售商以及一家餐馆收集了163种贝类样品,分别来自意大利南部的坎帕尼亚地区。一百一十七 鹦鹉螺 贻贝是从22个收割区获得的。从零售商店中获取了35种贻贝样品,还从其他来源(包括一家曾爆发疫情的餐馆)中获得了11种其他贝类。

总共94个贝类样品(57.7%)对诺如病毒的存在呈阳性,而GII是最常见的基因组。从零售商处购买的贝类中发现有74%的诺如病毒受到污染,而出售未包装贝类的未注册街头小贩中有超过一半的样品被诺如病毒污染。

但是,在从收获地区收集的贝类样品中有46.7%,在从零售商处收集的贝类样品中有55.9%,发现了来自GI和GII基因组的诺如病毒,表明在环境中存在很高的诺如病毒GI。这一发现与人类感染的数据不一致,后者表明诺如病毒GII在全球范围内具有明显优势,并且可能与诺如病毒GI菌株的水处理过程中对分解的更大抵抗力有关。

在2008-2009年和2011-2012年期间,从185个样本中 鸡没食子菌 贻贝,66 菲律宾磁带Ruditapes讨论 蛤,23 景天属 gigas 牡蛎和62个其他 多纳克斯 索伦 在意大利四个地区的A级和B级收获地区收集了该物种,并分析了诺如病毒GI和GII。根据所研究的人群,诺如病毒的患病率高达51.5%,且变异性大-2006年为47.8%。 景天属 在威尼托,占79.7% Mytilus 在坎帕尼亚(Campania),占84.6% 胶带 在撒丁岛。

诺如病毒污染对A级和B级生产区域的影响程度不同,污染发生率(22.1%对66.3%)和数量(3.1 x 10的平均污染水平)均具有统计学上的显着差异2 与1.9 x 103 份/克)。的 Mytilus , 胶带/糖皮景天属 从B类收获地区分析的物种分别显示诺如病毒的流行率分别为70.3%,66.0%和47.8%。研究中的其他两个双壳类 多纳克斯 索伦 ,显示相关诺如病毒的存在率分别为样本的40.0%和34.4%。

不列颠诸岛

在不列颠群岛的太平洋牡蛎的研究中, 景天属 gigas在两个地理上不同的生产区域的商业床中,分析了诺如病毒的存在。两个收割区都位于河口集水区的城市人口超过100,000的河口地区,并有可能受到为这些人口服务的可识别的市政下水道排放的影响。总共收集了237个样品。

2004年1月至2006年7月,从生产A处收集了145个样本,而2006年1月至2006年7月,从生产区B收集了92个样本,2005年5月至2005年6月有所中断。

对于生产区A,145个样本中有69个对诺如病毒GI和GII基因型均为阴性。在阳性样本中,两个基因组均为阳性,只有GI阳性的为18个,仅GII阳性的为16个。对于生产区域B,92个样本中有29个为阴性。在阳性样本中,两个基因组均为47阳性。

两个地区的结果都显示出强烈的季节性,在12月至2月之间记录了每月平均诺如病毒污染高峰,而在6月至8月之间则记录了最低水平。从10月到3月获得的牡蛎样本中,诺如病毒污染比该年剩余时间高出17倍。